バイオインフォマティクスにおける発光に関する技術は、分子や細胞の動態解析や遺伝子発現の可視化に関わる技術群を含む。まず、標的となる核酸やタンパク質に特異的に結合する抗体やアプタマー、融合蛋白質を用いた標識技術がある。これらはルシフェリンやルシフェラーゼ、イクオリン、セレンテラジンといった発光基質や蛍光体を介して発光信号を生成し、励起光や特定の波長の光源により励起される。発光したシグナルは対物レンズやフィルタを通して撮像装置、例えばｃｃｄカメラや光検出器で受光される。解析ではシグナルパルスの強度や寿命、バーコード化された配列情報を組み合わせて高精度なバイオマーカー解析や遺伝子発現管理が可能となる。さらに、組換えや形質転換技術によって発光タンパク質（ｆｐ）の融合や変異導入が行われ、蛍光寿命や波長特性の最適化、細胞内局在観察が進展している。これらの技術は増幅やハイブリダイズ（ハイブリダイゼーション）、伸長による標的検出と結びつくことで、微弱なシグナルの検出性能向上にも貢献する。免疫グロブリンの軽鎖やエピトープ特異性を利用した抗原－抗体反応も組み込まれ、より高感度な検出が可能となっている。総じて、発光を介したサンプルの観察および解析技術は核酸操作、タンパク質標識、光学系、撮像・解析システムが有機的に連携し、バイオインフォマティクス解析を支えている。
