バイオインフォマティクスにおけるアンチセンス鎖に関する技術は、主にアンチセンスオリゴヌクレオチドを用いたRNAサイレンシング技術を中心に展開される。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的となるmRNAのコドン配列に相補的な配列を持ち、これに結合することで転写後の遺伝子発現抑制を実現する。これらオリゴヌクレオチドにはホスホロチオエートヌクレオチドなどの修飾が施され、生体内での安定性向上やリガンドとのコンジュゲートによる細胞取り込み効率向上が図られる。さらに、ｓｉｒｎａやｉｒｎａといった短鎖RNAとの連携も研究されており、これらの技術群はｒｎａｉ経路を活用して標的RNAの分解や翻訳抑制に寄与している。解析段階では、増幅技術やシーケンシングによってサンプル中のアンチセンス鎖の効果評価を行い、修飾やキャップなどの構造的特徴も解析対象となる。加えて、リボザイムやオリゴマーの設計により、特定のモチーフを持つアンチセンス鎖の機能最適化が進められている。これらの技術群は、病態解析や遺伝子治療の基盤技術として活用され、例えばｋｒａｓ遺伝子や肝炎ウイルス関連遺伝子（ｈｂｖ、ｈｄｖ）に対する標的治療の開発にも寄与している。
