バイオインフォマティクスにおけるミトコンドリアに関する技術は、核酸解析やｒｎａの発現解析を中心に展開する。ｐｃｒやｒｐａを用いてミトコンドリア由来のｎａｓａ塩基配列を増幅し、プライマーセットによる標的の特異的検出が行われる。さらに、リアルタイムｐｃｒによりｍｒｎａやｍｉｒｎａの発現量を定量化する技術も含まれる。近年はｃｒｉｓｐｒ技術による特定遺伝子の編集やヌクレアーゼによる核酸断片の制御も活用されている。光学や電極を組み合わせた流体チャンバでのサンプル測定といったデバイス技術も、ミトコンドリア機能解析やバイオマーカー検出に寄与している。これらの技術群は、ミトコンドリアの酸化還元状態やアポトーシス関連遺伝子（例えばｂａｘやｂｉｍ、ｐｕｍａなど）の解析に用いられ、細胞機能の評価や疾患関連研究に不可欠な役割を担う。
