バイオインフォマティクスにおけるｍｉＲＮＡに関する技術は、ｍｉＲＮＡの配列解析や発現プロファイリング、ターゲット予測、バイオマーカー探索を中心とする。具体的には、ｍｉＲＮＡ配列の同定やｈｓａ、ｍｉｍａｔなどのデータベースを活用し、ｍｉＲＮＡの発現データをｃｆｄｎａやエキソソームペレットから取得してサンプル間で比較する技術が含まれる。また、メチル化やｃｐｇサイトの解析によってｍｉＲＮＡ遺伝子のエピジェネティックな調節機構も解析される。ｍｉＲＮＡのターゲットはｍＲＮＡの３’非翻訳領域の塩基配列情報を利用し、アンチセンスオリゴヌクレオチドやｐｕｆモチーフとの結合性を評価する技術も該当する。さらに、ｍｉＲＮＡを用いたバイオマーカーとしての感度や精度の評価も含む。これらの技術は、がん（大腸癌、ｃｒｃ）、炎症、アレルギーや喘息などの疾患状態の判別に用いられる。解析にはナノポアシークエンスなどの次世代シークエンシング技術や、ｎｃｂｉで整備されたリファレンスデータの利用も不可欠である。
